Bonjour Jean,
Il n'est jamais évident de retrouver exactement les mêmes réglages lors d'un changement de vélo. Par ailleurs, une selle différente implique très souvent de modifier légèrement son réglage et la forme du cintre et la position des cocottes ne sont pas identiques...
Bref, tout ça demande d'être affiné. Ensuite, il faut laisser ton corps s'habituer à la nouvelle position, ce qui signifie de réduire un peu les distances et l'intensité des sorties.
Mais, comme dit le kiné, tes douleurs ne sont pas forcément liées au changement de vélo. Personnellement, j'ai connu le même genre de douleur au mois de janvier alors que je roulais sur mon vélo habituel : bas du dos à gauche, quadriceps gauche (douleur + perte de force). Une IRM a révélé un rétrécissement du canal lombaire, d'où pincement du nerf crural. Je me suis contenté de faire des étirements et de la gymnastique douce pendant quelques temps et la douleur a disparu. Jusqu'à quand ? Je n'en sais rien.